建三江的土壤表层经常过湿是沼泽形成的直接原因，而土壤水分状况主要决定于气候。三江平原属温带湿润、半湿润季风气候，年平均降水量为500～600mm，虽不多，但季节分配不均，多集中于夏、秋两季，各地6～10月降水量占全年降水量的75～85％。至10月末或11月初，气温下降，大量水分来不及排除，被冻结在地表或土壤层中，水分以固体状况保存下来，致使翌年春季解冻，导致地表积水或过湿，加之冻结期长，冻层厚（深达1.5～2.1lm），土壤粘重，不利水分下渗，地表经常过湿，沼泽广泛发育。
三江平原是新构造运动长期下沉的地区，造成三面环山、中间低洼平坦的地形。周围山区降水量多，丰富的径流向平原汇集，而平原区地势极为低平，由西南向东北缓缓倾斜，总比降为1/10000，所以区内发育一些中小河流，多无明显河槽，属典型的沼泽性河流，泄水能力低。在长期下沉过程中，地表堆积了第四纪河湖相粘上沉积物，厚度一般达3～17m左右，这种粘土的粘粒含量较高，并富有铁铝氧化物、次生氧化硅、蒙脱石与水云母等胶体矿物，在浸水膨胀的情况下，增加了土壤的持水性，阻塞了土壤的孔隙，构成了深厚的不透水层，从而减弱或阻止地表水向下运行，积存起来形成沼泽。
